سيتم تطبيق نظام الثانوية العامة الجديد الطلاب الملتحقين بالصف الثاني العام المقبل حيث يدرسون سنة نقل عادية بنفس نظام الدراسة المعمول به في الصف الأول حالياً.. من خلال تطبيق نظام التقويم الشامل وأعمال السنة.
وسوف يدرس الطلاب فى الصف الثانى ثماني مواد منها اللغة العربية واللغة الأجنبية الأولي والثانية والرياضيات بالإضافة إلي المواد التخصصية الأدبية أو العلمية.
وفي الصف الثالث الثانوي سوف يدرس ثماني مواد أخري إلا أنه سيتم تقسيم طلاب العلمي إلي شعبتين الأولي شبعة العلوم الطبية المؤهلة للالتحاق بكليات الطب والعلوم .. وفيما يدرس الطالب ثماني مواد منها اللغة العربية واللغتان الأجنبيتان الأولي والثانية بالإضافة إلي خمسة مواد تخصصية هي الكيمياء والفيزياء والأحياء والجيولوجيا والإحصاء.
أما الشعبة الثانية فهي شعبة العلوم الهندسية والحاسبات وفيها يدرس الطالب ثماني مواد أيضاً هي اللغة العربية واللغتان الأجنبيتان بالإضافة إلي المواد الخمس التخصصية وهي الكيمياء والفيزياء والرياضيات والجيولوجيا والإحصاء..وفي الشعبة الأدبية سوف يدرس الطالب اللغة العربية واللغتين الأجنبيتين والتاريخ والجغرافيا والاقتصاد والفلسفة وعلم النفس.